即时热门 16srdna测序一个样本价格（解读16srdna测序价格的因素及优化措施）

一、16s rrna测序价格

菌种鉴定有多种方法，而通过DNA测序鉴定的方法被誉为金标准。DNA 测序进行菌种鉴定的结果比传统生化鉴定更为直接，鉴定结果也更为可靠。核糖体RNA（rRNA）是生物细胞中主要的核糖核酸之一。rRNA分子的一级结构既具有高度保守性区域，又具有高度变化特异性区域。保守区域反映了生物物种间的亲缘关系，可用于构建生命统一进化树，而高度变化特异区域则能表明物种间的差异，可用于区别属或者种。

细菌具有5S, 16S, 23S三种rRNA，其中5S rRNA序列较短，包含的细菌遗传信息量少，不适合用于分析鉴定细菌种类，而23S rRNA序列较长，且碱基突变速率要比16S rRNA快得多，不适用对较远亲缘关系的细菌进行鉴定。16S rRNA其大小约1500 bp ，所代表的细菌遗传信息量适中，是进行细菌分类研究的理想材料。

细菌16S rDNA是细菌染色体上编码16S rRNA的DNA序列，存在于所有细菌染色体基因中，它由保守区序列及可变区序列两部分组成。细菌16S rDNA的可变区序列能够显示细菌间不同分类等级水平上的特异性，适用于进化距离不同的各类生物亲缘关系的研究，并可作为测量细菌进化和亲缘关系的良好工具，同时可以利用可变区序列的差异对不同菌属、菌种的细菌进行分类鉴定。

服务内容：

提取客户提供的细菌菌株基因组总DNA，扩增细菌16S rDNA序列，对细菌16S rDNA序列进行序列测定，分析细菌16S rDNA序列信息，确定客户样品细菌种属关系。

您需要提供的信息：

1) 试管菌、甘油菌、体积大于500ul的细菌菌液或细菌DNA。

2) 所送样品可能的分类地位、已知生长性状、分离环境条件、所提供的DNA纯度等。

3) 细菌样品是否具有致病性和潜在危险，如您对样品具有一定的致病性或均有潜在的危险，请您提供细菌DNA。

服务价格：

1) 细菌16S rDNA部分序列分析：300元/样品

2) 细菌16S rDNA全序列分析：500元/样品

服务周期：

30样品以下10-15个工作日内递交结果。如遇到特殊情况，我们会及时与您联系，保证尽早发货。

30样品以上依据具体样品数量而定。

服务承诺：

我们提供给您细菌样品的测序锋图，序列比对结果及完整的结果分析报告。

客户须知：

1) 我们的一次性收费包括细菌DNA提取，细菌16S rDNA 序列扩增，扩增产物纯化及16S rDNA序列测序费用。

2) 细菌鉴定服务完成后相应的菌株为您保存1个月，一月后将统一销毁。

3) 常温运输时间过长会导致菌体老化，细胞壁难以破碎，因此对于试管菌，建议您使用冰袋运输。

4) 如果测序结果出现套峰，视为样品不纯，因实验样品不纯造成的测序套峰，将收取全额实验费用。

5) 我们不接受有致病性菌种的鉴定。

二、16srdna测序多少钱

根据安康人民政策采购法安康人民政策采购法实施条例云南省人民政策办公厅关于印发云南省政策集中采购目录及标准（2021年版）的通知（云政办函〔2020〕115）等文件，云南省畜牧兽医科学院将询价采购绵羊粪便16S rDNA测序、非靶向代谢组学及全血个体重测序，用于开展西南地区绵羊肠道微生物与遗传背景研究。现邀请具备相应供货能力的供应商就本项目参与报价。

一、项目基本情况

项目名称：云南省畜牧兽医科学院绵羊粪便16S rDNA测序、非靶向代谢组学及全血个体重测序询价采购

采购方式：询价采购

预算金额：282,800元

更高限价：282,800元

采购需求：

合同履行期限：签订合同之日起1年内（特殊情况以合同约定为准）；

交货地点：云南省畜牧兽医科学院；

本项目（否）接受联合体；

供应商必须整体进行投标，不得缺项、漏项，报价包含全部服务内容，否则其报价将视为无效报价。

二、供应商资格要求

（一）满足安康人民政策采购法第二十二条规定；

（二）安康人民境内注册的具有独立法人资格，提供有效的生物技术研发、服务的营业执照，经营范围与本项目需求相符；

（三）企业经营及财务状况良好；

（四）具有履行本项目所必需的专注设备、专注技术队伍；

（五）近三年内在经营活动中没有重大违法记录；

（六）、行政法规等规定的其他条件。

三、询价采购说明

（一）发布公告。2023年6月16日在云南省农业农村厅网站和云南省畜牧兽医科学院网站发布询价采购公告。

（二）询价响应文件及要求

2、询价响应文件

（1）时间：2023年6月25日8:30至9:00

（2）：昆明盘龙区金殿青龙山云南省畜牧兽医科学院行政1会议。

（三）会议评审。院询价采购工作小组将对符合要求的响应文件进行评审并确定供应商，评审结果在云南农业农村厅网站和云南省畜牧兽医科学院网站进行公示。

（四）公示。公示期结束且未收到异议，与确定成交供应商签订采购合同，按合同条款执行。

四、公告期限

自本公告发布之日起3个工作日。

五、联系人及电话

联系人：廖德芳、孙强

0871-65019657

云南省畜牧兽医科学院

2023年6月16日

（拟稿人：廖德芳 审核人：孙强）

三、16srrna测序技术优点

16S rDNA/18S rDNA/ITS扩增子测序

16S rDNA 扩增子测序：16S rDNA为原核生物中编码核糖体小亚基rRNA的DNA序列，具有9个高变区域（V1-V9）和10个保守区域，其中保守区反映细菌种属间亲缘关系，高变区反映了物种间的特异性，选择通用引物进行PCR扩增，进而通过新一代测序技术对16S rDNA的单个或多个高变区进行测序，来分析环境或者临床样本中古菌或细菌的群落结构多样性。

18S rDNA扩增子测序：18S rDNA真核生物中编码核糖体小亚基rRNA的DNA序列，具有可变区（V1-V9、没有V6区）和保守区。保守区反映生物物种间的亲缘关系，高变区反映物种间的差异。选择通用引物进行PCR扩增，进而通过新一代测序技术对18S rDNA的高变区（一般选择V4区）进行测序，来分析环境或者临床样本中真核生物群落结构多样性。

ITS扩增子测序：ITS分为两个区域：ITS1/ITS2、其中ITS1位于真核生物核糖体rDNA序列18S和5.8S之间，ITS2位于真核生物核糖体rDNA序列5.8S和28S之间。通过新一代测序技术对ITS1或者ITS2进行测序，进一步做环境微生物中真菌多样性分析。

实验线

数据分析流程

方案策略

样本要求（技术参数）环境及临床样本（干冰或冰袋运送）

土壤≥ 10 g（污染土壤样本要适当增加送样量，20 g）；粪便≥ 2 g；

水体样本：滤膜(0.22 µm滤膜) ≥ 2个；拭子样本≥ 2个；

DNA/PCR产物（干冰或冰袋运送）

DNA：浓度≥ 20 ng/μL；总量≥ ng；DNA要有明显主带，无降解；OD260/280= 1.8-2.0

数据分析结果展示

稀疏性曲线 香农指数曲线

案例解析

案例一 乙酸盐有利于好氧颗粒污泥对发酵液中磷的富集

原文出处：Cai W, Huang W, Li H, et al。 Acetate favors more phosphorus accumulation into aerobic granular sludge than propionate during the treatment of synthetic fermentation liquor。 Bioresource technol。 2016, 214: 596-603、

案例二 肠芽囊原虫可以增加人类肠道细菌微生物的多样性

本文通过二代测序平台Ion Torrent对48个肠道定植有牙囊原虫的病人的粪便样本以及48个正常人的粪便样本进行16S rDNA的V3-V5区进行测序，结果表明定植有牙囊原虫的病人的肠道细菌多样性比健康人的丰富，其中梭状芽胞杆菌比较丰富，而肠杆菌相对要少。这个结果表明，肠道中定植有牙囊原虫可以营造一个健康的肠道微生物多样性，而不会造成肠道微生物多样性的失衡。

原文出处：Audebert C, Even G, Cian A, et al。 Colonization with the enteric protozoa Blastocystis is associated with increased diversity of human gut bacterial microbiota。 Sci rep。 2016, 6、

案例三 产道液体擦拭婴儿身体可以部分恢复剖腹产婴儿的微生物多样性

剖腹产婴儿从母体获得微生物的种类与自然分娩婴儿从母体获得的微生物的种类有很大的差别，这些微生物种类的差异回来代谢紊乱和免疫紊乱的风险，因此如何避免剖腹产造成的婴儿微生物种类变化变得十分重要，本研究用母体产道液体来对剖腹产婴儿进行擦拭，30天后通过16S rDNA测序技术对剖腹产婴儿的皮肤，口腔和肠道进行微生物的多样性检测，发现用产道液体擦拭的剖腹产婴儿的微生物多样性与自然分娩婴儿的微生物多样性相似。同时也证明了，剖腹产婴儿肠道，皮肤和口腔微生物只能部分通过从母体获得。

用无菌纱布将产妇产道液体擦拭剖腹产婴儿的嘴，脸及身体其他部分的操作流程

原文出处：Dominguez-Bello M G, De Jesus-Laboy K M, Shen N, et al。 Partial restoration of the microbiota of cesarean-born infants via vaginal microbial transfer。 Nat med, 2016、

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